課程資訊
課程名稱
基因體統計方法導論
Statistical Analysis for Genomic Data 
開課學期
109-2 
授課對象
學程  生物統計學程  
授課教師
劉力瑜 
課號
Agron5049 
課程識別碼
621 U6380 
班次
 
學分
3.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
農藝304 
備註
總人數上限:20人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1092Agron5049_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

基因體研究主題相關之統計方法介紹與推導。主要以板書授課。 

課程目標
建立學生基因體研究之數理推導與閱讀文獻能力 
課程要求
閱讀英文文獻並製作摘要
參與課堂討論 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
作業 
50% 
 
2. 
課堂參與 
50% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/25  Introduction 
第2週
3/4  Reading material (no class):
Lange1-2.pdf Section 1.1~1.2
R_StatGene1-2.pdf Section 1.2 
第3週
3/11  Basic concepts in probability models and likelihood theory 
第4週
3/18  Gene frequency estimation / EM / Bayesian 
第5週
3/25  Pedigree analysis; Practice (I)  
第6週
4/1  No class 
第7週
4/8  Linkage analysis (regression): introduction 
第8週
4/15  Linkage analysis (regression): regression (REG) interval mapping 
第9週
4/22  Introduction to Phylogenetics 
第10週
4/29  Practice (II): Read Section 4.1 ~ Section 4.3 
第11週
5/6  Distance based method 
第12週
5/13  Probability based methods
【重要通知】因應疫情本週 (5/13) 起開始採線上授課。課程內容會預錄並放在 NTU Cool 網站,若有疑問請聯繫授課教師。 
第13週
5/20  Practice (III): 個人報告連結放在 NTU Cool 網站。 
第14週
5/27  Special topic 1 (I) RNA-seq 
第15週
6/3  Special topic 1 (II) RNA-seq 
第16週
6/10  Special topic 2 (I) metagenomics - Dr. 郭志鴻 (中研院植微所)
會議鏈結: https://meet94.webex.com/meet/pr1829868486 
第17週
6/17  Special topic 2 (II) metagenomics - Dr. 吳泓熹 (110/8 生統組新進教師)
會議鏈結: https://meet.google.com/mek-kqtm-vkq